La prise en charge médicale de ce reflux est la première étape indispensable. Celle-ci sera faite au mieux par le gastro-entérologue pédiatre, en relation avec votre médecin traitant. Il fait appel à plusieurs types de produits différents :

• des médicaments visant à empêcher ou à diminuer le reflux
• des médicaments visant à protéger la muqueuse de l'œsophage
• et surtout des médicaments visant à diminuer la quantité d'acide fabriquée par l'estomac. En effet, si le reflux peut difficilement être combattu de façon efficace, ses conséquences, au contraire sont plus faciles à combattre. Si le reflux n'est plus acide, il sera moins douloureux, moins gênant, les manifestations pulmonaires et ORL en diminution (si elles sont liées au reflux). Par contre cela n'aura aucun effet sur les régurgitations, les vomissements ou la mauvaise haleine.

Ces traitements seront poursuivis pendant plusieurs mois voire plusieurs années. En effet, le reflux peut se stabiliser, s'améliorer, voire disparaître avec la croissance. Il sera parfois nécessaire de modifier les médicaments, de changer les doses. Tout ce suivi se fera au cours des consultations avec le gastro-entérologue pédiatre. Il sera parfois utile de refaire certains des examens complémentaires que nous avons vus pour juger de l'amélioration "objective". C'est le cas surtout de la pH-métrie.

L'absence de réponse à ce traitement bien conduit et pendant suffisamment longtemps, ou la résistance progressive à ce traitement (augmentation régulière des doses, réapparition des symptômes) doit faire envisager des alternatives thérapeutiques, et en particulier la chirurgie.

De même, la dépendance au traitement (impossibilité de diminuer les doses, voire d'arrêter le traitement) va également conduire à discuter l'opportunité d'une solution chirurgicale.

Enfin, un cas particulier : les enfants qui souffrent d'un déficit moteur ou intellectuel, et qui présentent un reflux, vont être rapidement candidats à une intervention chirurgicale, pour améliorer leur qualité de vie et faciliter celle de leurs proches.